Özellikle kedi ve köpeklerde jinekolojik muayenelerde, ovaryumlar ve üzerindeki yapıların belirlenmesi, genital kanal tümörlerinin, kistik endometriyal hiperplazi ve pyometra gibi uterus hastalıklarının teşhisi ve tedavilerinin takibi gibi çeşitli alanlarda oldukça sık kullanılmaktadır. Kedi ve köpeklerde jinekolojik ultrasonografinin etkin şekilde kullanılabilmesinin ancak hekimin tecrübesi ile mümkün olduğu unutulmamalıdır.